Jurusan Perikanan dan Jurusan Ilmu Kelautan FPIK saat ini menempati gedung berlantai dua dengan luas 1044,29 m2 yang peruntukannya sebagai ruang kuliah, laboratorium, perpustakaan, ruang administrasi, ruang dosen, aula dan ruang rapat. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan memiliki 6 laboratorium yaitu tiga laboratorium pada Jurusan Perikanan (Laboratorium Lingkungan dan Sumberdaya Perairan, Laboratorium Mikrobiologi dan Nutrisi, dan Laboratorium Budidaya Perairan) serta 3 Laboratorium pada Jurusan Ilmu Kelautan (Laboratorium Ekologi dan Biologi laut, Laboratorium Oseanografi, Akustik dan Penginderaan jauh, serta Laboratorium Kimia Bahan Hayati Laut).
Laboratorium Budidaya Perikanan
Laboratorium Lingkungan dan Sumberdaya Perairan
Laboratorium Mikrobiologi dan Nutrisi
Laboratorium Oseanografi, Akustik dan Penginderaan jauh
FPIK memiliki perpustakaan yang khusus menyediakan buku/artikel dalam bidang kelautan dan perikanan. Terdapat 1.824 judul buku dengan jumlah copy sebanyak 2.185 buku yang berasal dari buku teks, jurnal nasional terakreditasi, jurnal internasional, prosiding, profil dan atlas, buletin/majalah, skripsi, laporan PKL, Laporan KKN, makalah, proposal, disertasi/ tesis dan lainnya. Untuk prasarana pendukung di FPIK UNIPA antara lain terdapat ruang HMJ, tempat parkir, tempat olahraga, ruang teknisi laboratorium, PMB dan toilet.
Laboratorium Perikanan dan Kelautan
Sekretariat PMB, Ruang HMJ Perikanan, HMJ Ilmu Kelautan dan Toilet